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自然亚历克斯·班迪奥技术,陈嘉/黄·徐幸/杨

来源:头条 编辑:小编 时间:2019-01-12
   责任制    封面设计是由以及其他人岁的袁钟毅绘制的。0 自然10 高德利等人T到G3,李,十20 - 424 ( 2018 )。 8。 上海科技大学硕士学位研究生。    近年来,通过整合西田Nat Biotechnol 35,435 - 43Nat Chem Biol 8,751 - 758 ( 2012年) ( 2017年)I3PR/Cas基因编辑酶( e( 2018年)g。、CRIPR/Cas9、CRISPR/Cpf1等。)与核酸脱氨酶编辑酶( e。g。、胞嘧啶脱氨酶以及其他人PO利用原核和脊椎动物混合适应性免疫系统进行靶向核苷酸编辑EC/AID、腺嘌呤脱氨酶ADAR等。)可以在单个碱基水平( C - to、A - G )上实现基因的有效定向编辑和修饰;;)【1 - 6。】。这种新的碱基编辑系统理论上可以在固定的时间点纠正基因组中数百个导致人类疾病的单碱基突变,因此具有很大的临床应用潜力。基础编辑技术在2017年被评为世界十大科学突破之一。《科学》杂志,进一步突出了该领域在科学研究和临床应用方面的重要潜力。    尽管在David Liu和其他人的努力下,单个碱基的自由替换是可以实现的(在《自然- ATGC》上发表的基因编辑的最新成果中的突破)[ 7可以自由替换而不切割DNA ][ 7 ],但是,由于在一些人类疾病中可能发生的碱基T到C的突变以及CpG二核苷酸位点容易被DNA甲基化修饰,因此, 当前基于APOBBEC 1 / AID脱氨酶的单碱基基因编辑方法在遇到甲基化的CpG二核苷酸位点时会大大降低其效率(在哺乳动物基因组中,CpG位点的胞嘧啶通常很容易甲基化),这一点受到很大限制,因为APOBBEC 1 / AID脱氨酶的活性会被甲基化的DNA[ 8抑制]。    上海科技大学生命科学与技术学院的陈嘉教授的研究小组和黄徐幸教授的研究小组与中国科学院马克斯·普朗克计算生物学研究所的研究员杨莉的研究小组进行了合作研究。他们成功开发了一系列基于人胞嘧啶脱氨酶APOBEC的新型通用基础编辑器,其中基础编辑器基于人APOBEC 3。A(hA3A )能有效地介导甲基化胞嘧啶mC编辑成胸腺嘧啶t。 相关工作于北京时间8月20日在网上发表,主题是“利用人类Apobec 3A - CA S9融合在甲基化区域高效编辑碱基”,内容涉及自然生物技术。    在这项最新的研究中,合作团队首先使用生物信息学方法系统分析了与人类疾病相关的单碱基突变,发现大多数胸腺嘧啶T -胞嘧啶C突变位于CpG二核苷酸位点( ~ 4.3 % )。    为了在超甲基化区域实现高效的碱基编辑,合作团队的成员利用来自不同物种的10多种APOBEC胞嘧啶脱氨酶家族蛋白构建了一系列新的碱基编辑器,可广泛用于胞嘧啶C到胸腺嘧啶T的单碱基编辑。更重要的是,通过一系列筛选和鉴定,合作团队发现基于人类APOBEC3A的碱基编辑器( hA3A - BE )可以在基因组高度甲基化的区域实现高效的甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T单碱基编辑。    深入研究发现,hA3A - BE是一种通用且高效的基本编辑器,可以在多种检测环境中高效地将胞嘧啶C (或甲基化胞嘧啶mC )编辑为胸腺嘧啶T。最后,通过对人类APOBEC3A的系统改造,研究团队成功地缩小了hA3A - BE的编辑范围,进一步提高了其基础编辑的准确性。与以前报道的基于rat APOBEC1的基础编辑器相比,基于人类APOBEC3A的新基础编辑器具有更广泛和更全面的应用范围,为基础编辑系统在基础研究和未来临床领域的全面和深入应用提供了新的工具、新的方法和新思路。    ( a )构建多个基础编辑器,并在超甲基化区域筛选基础编辑器的编辑效率;B ) hA3A - BE3可以在超甲基化区域进行有效的碱基编辑    据报道,这项工作是在研究员杨莉、陈嘉教授和黄徐幸教授的共同指导下完成的。王晓,上海科技大学生命学院陈嘉研究小组的研究生,王星,2015的研究生。在黄徐幸的研究小组中,博士。免疫化学研究所的杨贝和中国科学院计算生物学研究所杨莉研究小组2015年研究生王283以及研究助理贾伟是共同的主要作者,他们。    基因组编辑的未来。牢房,173。《细胞》杂志编辑April Pawluk (左起)和博士合影。在苏州举行的亚洲冷泉港会议期间( 2018年4月23日至27日),陈嘉(左起第二)、普拉珊特·马里(左起第三)和纪魏徵院士(左起第四)。图片引用:陈军。 ,冀,西。    ,&马里,P。( 2018年)。基因组编辑的未来。 牢房,173。 参考。 1。 科莫,阿。 C。    金,你。B。封隔器,M。S。朱里斯。A。刘丹。r。    基因组DNA中目标碱基的可编程编辑,不需要双链DNA切割   1。 2。C。以及其他人。B。科学353 ( 2016 )。S。金,金。A。 高效RNA引导的小鼠胚胎碱基编辑。R。 4。 宗庆后。   2。 用Cas9 -胞苷脱氨酶融合技术精确编辑水稻、小麦和玉米的碱基。 Nat Biotechnol 35,438 - 440 ( 2017年)。 5。 胡杰。   3。 以及其他人。进化的Cas9变体具有广泛的PAM相容性和高DNA特异性。 自然556、57 - 63 ( 2018 )。 6。   4。 以及其他人。Cpf1 -胞苷脱氨酶融合的碱基编辑。 NAT Biotechnol 190 36,324 - 327 ( 2018年)。 7。   5。 可编程基础编辑。H。没有DNA切割的基因组DNA中。 自然,551 ( 7681 ),464。 ( 2017年)。   6。 加拿大纳贝尔。S。 以及其他人。 AID/APOBEC脱氨基化了DNA脱甲基化过程中不利的修饰胞嘧啶   7。 BioArt,专注于生命科学,只是为了分享更有趣和信息更丰富的信息。 请联系微信id : fullbellies或电子邮件: sinobioart @ bioart,以获得提交、合作和重印的授权? 通讯器? 氯化萘。 。   8。 。S。。 。    。。

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